Debbo essere onesto, è parecchio che uso poco, per non dire niente Windows.... mi limito ad Explorer per vedere come funzionano i siti e praticamente null'altro. Prossimamente l'userò per testare un'applicazione che voglio fare compatibile per i sistemi operativi maggiori.
Però.... oggettivamente, con Windows puoi essere anche un mago ma oltre ad un certo limite è dura andare, puoi modificare manualmente le chiavi di registro (per esempio), cosa già non alla portata di tutti o intervenire a basso livello su alcune cose, ma lui continua a piazzare cartelle nascoste e magari neanche visibili quando ci sei dentro (ho trovato alcune cartelle solo usando Linux per leggere il disco, lo sanno quelli che fanno le famose analisi forensi per i tribunali). Insomma è impossibile controllare tutto quello che fa, su Linux c'è una documentazione incredibile (italiana, inglese ma c'è) a tutti i livelli, su Windows trovi solo cose superficiali o cose che capisci solo se programmi e comunque sempre mancanti di qualcosa... non per nulla i codici di Windows sono chiusi e questa non è una garanzia.
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